这是一项关于缅因猫长期近亲繁殖的研究。
    我想知道今天它在我们品种中的情况,所以我从 PawPeds 数据库中收集了信息。我收集了 2019 年出生的所有缅因猫的数据。我选择并删除了所有超过 10% 无法追溯到基础猫的猫。我还收集了所有 2019 年出生的挪威森林猫和西伯利亚森林猫的数据。
    这三个都是所谓的自然品种,这意味着它们不是人工培育的品种,也不是所谓的设计品种。
    我们都知道,我们这个品种(缅因猫)有一个很大的瓶颈,这是由我们称之为克隆猫的 17 个兄弟姐妹造成的。我们知道许多猫的克隆百分比很高,但我们不知道它与我们称为远交的猫相比究竟如何,后者的比例较低(在克隆中低于 20%)。
    首先,我收集了所有数据,之后我对数据进行了排序并创建了图表以使其更加直观。

    本文中的 COI 是一直追溯至基础猫的总近亲繁殖,系谱中缺少了不到 10% 的信息,当您查看图表中显示的 COI 时请记住这一点。

    您可以在下面看到一张图表,显示收集的猫 (MCO) 与克隆的 COI(追溯至基础猫的总近亲繁殖率)。
    我将从一张图表开始,显示收集的猫的 COI 与克隆值。
    正如您所看到的,在纵轴克隆比例的33-37%区间我们得到了最大的集群,现今的大多数猫都位于这个区间,在横轴的COI方向在这个区间的猫也集中于13-20%的COI范围内。在克隆轴中中低于20%的远交猫均位于COI的5-10%区域。

    克隆与 COI,垂直百分比是克隆,水平百分比是所有收集的猫的 COI。

Clones vs COI

    我还查询了缅因猫品种的情况,如果你从 5 代、COI 和克隆中获取收集的猫的所有数字,并将它们放在图表中以便更好地了解它们。这就是图表所呈现的样子:
    纵轴是 COI 和克隆的百分比,横轴是猫的数量。你可以看到五代的近亲繁殖是如何处于最底层的,只有少数例外。
    然而,除了少数例外,克隆比例和 COI 密切相关。但在这里您也可以看到猫被认为是远交的猫有着20%或者更低的克隆比例。(我们也可以查看基础猫,但我在本文中没有这样做,也许那是另一个项目的事情)。
    克隆线呈流线型而其他线条上下波动的原因是我把猫按克隆从低到高的顺序进行了排序。由于每只猫都有自己的编号,因此其他线条会随着每只猫上下波动。
Numbers for 5 gen COI and Clones in Maine Coon

    我做的下一件事是将缅因猫与其他两个自然品种 Norweigan Forest Cat 和 Siberian 进行比较。这就是它变得非常有趣的地方。虽然几乎 80-90% 的缅因猫在 15% 或更高的范围内,但西伯利亚猫的 COI 大多低于10%,最多在 11-12% 左右,挪威森林猫的 COI 大多低于5%。
   MCO、NFO 和 SIB 之间的 COI 比较
Comparison of COI between MCO NFO and SIB

    我还比较了缅因猫品种的克隆比例和一只特别的NFO(挪威森林猫)Pans Polaris(在挪威森林猫中,公猫Pan Polaris也被过度使用)进行比较。我的想法是在未来扩展这种分析并回顾历史,看看如果我比较这两个品种的发展情况。
   正如您所看到的,缅因猫的克隆比例平均在 35-40% 左右,而大多数挪威森林猫都在 10-15% 之间。

Clones vs Pan Polaris

    我进行了更深层次的对比,并根据克隆程度将猫分成几组。
    第一组是克隆百分比低于 20% 的猫,那些被认为是异交(远交)的猫。

    纵轴是克隆和 COI 的百分比,横轴是猫的数量。
Clones under 20 COI compared to Clones cats considered outcross

    下一组是克隆率在 20-30% 之间的猫。同样在这里,纵轴是克隆和 COI 的百分比,横轴是猫的数量。

Clones 20 30 COI compared to Clones

下一组是克隆率30 -35% 的猫,纵轴是克隆和 COI 的百分比,横轴是猫的数量。

Clones 30 35 COI compared to Clones

   最后,克隆率35% 及以上的猫的比较,纵轴是克隆和 COI 的百分比,横轴是猫的数量。

Clones over 35 COI compared to Clones

    正如您在查看这些图表时可以非常清楚地看到的那样,COI 确实会随着克隆率的上升而上升,因此即使克隆是 40 年前出生的,它们也绝对会影响我们品种的近亲繁殖。
    最后一张图表显示了四个不同组的 COI。

Comparison of COI for different groups of percentage of clones

作者:Malin Sundqvist